Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHE23Q8NDY6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHE23Q8NDY6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHE23Q8NDY6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHE23Q8NDY6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHE23Q8NDY6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHE23Q8NDY6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHE23Q8NDY6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHE23Q8NDY6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHE23Q8NDY6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHE23Q8NDY6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BHLHE23Q8NDY6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
BHLHE23Q8NDY6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
BHLHE23Q8NDY6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
BHLHE23Q8NDY6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
BHLHE23Q8NDY6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHE23Q8NDY6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms