Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM87AQ8NBN3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM87AQ8NBN3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms