Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I0

SYT2, Synaptotagmin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT2Q8N9I0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT2Q8N9I0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SYT2Q8N9I0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SYT2Q8N9I0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYT2Q8N9I0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYT2Q8N9I0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYT2Q8N9I0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYT2Q8N9I0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYT2Q8N9I0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYT2Q8N9I0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYT2Q8N9I0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYT2Q8N9I0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYT2Q8N9I0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYT2Q8N9I0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYT2Q8N9I0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYT2Q8N9I0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYT2Q8N9I0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYT2Q8N9I0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SYT2Q8N9I0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYT2Q8N9I0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYT2Q8N9I0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYT2Q8N9I0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYT2Q8N9I0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYT2Q8N9I0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYT2Q8N9I0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT2Q8N9I0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT2Q8N9I0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT2Q8N9I0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT2Q8N9I0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT2Q8N9I0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT2Q8N9I0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT2Q8N9I0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT2Q8N9I0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT2Q8N9I0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT2Q8N9I0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT2Q8N9I0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT2Q8N9I0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT2Q8N9I0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT2Q8N9I0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT2Q8N9I0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms