Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z0

KRT25, Keratin, type I cytoskeletal 25, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT25Q7Z3Z0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT25Q7Z3Z0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT25Q7Z3Z0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT25Q7Z3Z0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT25Q7Z3Z0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT25Q7Z3Z0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT25Q7Z3Z0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT25Q7Z3Z0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT25Q7Z3Z0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT25Q7Z3Z0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT25Q7Z3Z0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT25Q7Z3Z0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT25Q7Z3Z0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT25Q7Z3Z0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT25Q7Z3Z0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT25Q7Z3Z0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT25Q7Z3Z0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT25Q7Z3Z0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT25Q7Z3Z0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT25Q7Z3Z0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT25Q7Z3Z0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT25Q7Z3Z0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT25Q7Z3Z0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT25Q7Z3Z0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT25Q7Z3Z0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT25Q7Z3Z0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT25Q7Z3Z0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT25Q7Z3Z0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT25Q7Z3Z0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT25Q7Z3Z0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT25Q7Z3Z0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT25Q7Z3Z0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT25Q7Z3Z0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT25Q7Z3Z0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT25Q7Z3Z0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT25Q7Z3Z0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT25Q7Z3Z0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT25Q7Z3Z0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT25Q7Z3Z0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT25Q7Z3Z0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT25Q7Z3Z0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT25Q7Z3Z0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT25Q7Z3Z0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT25Q7Z3Z0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT25Q7Z3Z0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT25Q7Z3Z0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT25Q7Z3Z0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT25Q7Z3Z0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT25Q7Z3Z0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT25Q7Z3Z0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT25Q7Z3Z0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT25Q7Z3Z0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT25Q7Z3Z0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT25Q7Z3Z0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT25Q7Z3Z0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT25Q7Z3Z0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT25Q7Z3Z0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT25Q7Z3Z0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT25Q7Z3Z0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT25Q7Z3Z0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT25Q7Z3Z0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT25Q7Z3Z0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT25Q7Z3Z0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT25Q7Z3Z0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT25Q7Z3Z0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT25Q7Z3Z0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT25Q7Z3Z0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT25Q7Z3Z0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT25Q7Z3Z0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT25Q7Z3Z0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT25Q7Z3Z0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT25Q7Z3Z0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT25Q7Z3Z0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT25Q7Z3Z0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT25Q7Z3Z0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT25Q7Z3Z0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT25Q7Z3Z0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT25Q7Z3Z0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT25Q7Z3Z0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT25Q7Z3Z0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT25Q7Z3Z0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT25Q7Z3Z0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT25Q7Z3Z0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT25Q7Z3Z0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT25Q7Z3Z0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT25Q7Z3Z0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT25Q7Z3Z0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT25Q7Z3Z0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT25Q7Z3Z0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT25Q7Z3Z0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT25Q7Z3Z0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT25Q7Z3Z0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT25Q7Z3Z0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT25Q7Z3Z0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT25Q7Z3Z0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT25Q7Z3Z0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT25Q7Z3Z0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT25Q7Z3Z0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT25Q7Z3Z0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT25Q7Z3Z0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms