Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
APTXQ7Z2E3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APTXQ7Z2E3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms