Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMUB2Q71RG4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMUB2Q71RG4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms