Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMBR1LQ6UX01 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMBR1LQ6UX01 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms