Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFCAB12Q6NXP0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms