Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS38

ALKBH2, DNA oxidative demethylase ALKBH2, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH2Q6NS38 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALKBH2Q6NS38 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms