Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RCSD1Q6JBY9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCSD1Q6JBY9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms