Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG16L1Q676U5 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms