Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RNF123Q5XPI4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF123Q5XPI4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms