Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BEND3Q5T5X7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BEND3Q5T5X7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BEND3Q5T5X7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BEND3Q5T5X7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BEND3Q5T5X7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BEND3Q5T5X7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
BEND3Q5T5X7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BEND3Q5T5X7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BEND3Q5T5X7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BEND3Q5T5X7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BEND3Q5T5X7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BEND3Q5T5X7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BEND3Q5T5X7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
BEND3Q5T5X7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BEND3Q5T5X7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BEND3Q5T5X7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BEND3Q5T5X7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BEND3Q5T5X7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BEND3Q5T5X7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BEND3Q5T5X7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BEND3Q5T5X7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BEND3Q5T5X7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BEND3Q5T5X7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
BEND3Q5T5X7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BEND3Q5T5X7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BEND3Q5T5X7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BEND3Q5T5X7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
BEND3Q5T5X7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BEND3Q5T5X7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
BEND3Q5T5X7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
BEND3Q5T5X7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BEND3Q5T5X7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BEND3Q5T5X7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BEND3Q5T5X7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BEND3Q5T5X7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BEND3Q5T5X7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BEND3Q5T5X7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BEND3Q5T5X7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BEND3Q5T5X7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BEND3Q5T5X7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BEND3Q5T5X7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BEND3Q5T5X7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
BEND3Q5T5X7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BEND3Q5T5X7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BEND3Q5T5X7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BEND3Q5T5X7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BEND3Q5T5X7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BEND3Q5T5X7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BEND3Q5T5X7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BEND3Q5T5X7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms