Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP78Q5JTW2 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP78Q5JTW2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP78Q5JTW2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEP78Q5JTW2 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEP78Q5JTW2 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEP78Q5JTW2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEP78Q5JTW2 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEP78Q5JTW2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEP78Q5JTW2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEP78Q5JTW2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEP78Q5JTW2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEP78Q5JTW2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEP78Q5JTW2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEP78Q5JTW2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEP78Q5JTW2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEP78Q5JTW2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CEP78Q5JTW2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CEP78Q5JTW2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEP78Q5JTW2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEP78Q5JTW2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEP78Q5JTW2 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEP78Q5JTW2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEP78Q5JTW2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEP78Q5JTW2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEP78Q5JTW2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEP78Q5JTW2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEP78Q5JTW2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEP78Q5JTW2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEP78Q5JTW2 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms