Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRC9

FAM47A, Protein FAM47A, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47AQ5JRC9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM47AQ5JRC9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM47AQ5JRC9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms