Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL12Q53G59 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms