Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0N0

GGTA1P, Inactive N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTA1PQ4G0N0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GGTA1PQ4G0N0 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GGTA1PQ4G0N0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GGTA1PQ4G0N0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GGTA1PQ4G0N0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GGTA1PQ4G0N0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GGTA1PQ4G0N0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GGTA1PQ4G0N0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GGTA1PQ4G0N0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GGTA1PQ4G0N0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GGTA1PQ4G0N0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GGTA1PQ4G0N0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GGTA1PQ4G0N0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GGTA1PQ4G0N0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GGTA1PQ4G0N0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms