Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HFEQ30201 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HFEQ30201 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HFEQ30201 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HFEQ30201 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HFEQ30201 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HFEQ30201 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HFEQ30201 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HFEQ30201 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HFEQ30201 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HFEQ30201 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HFEQ30201 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HFEQ30201 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HFEQ30201 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HFEQ30201 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HFEQ30201 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HFEQ30201 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HFEQ30201 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HFEQ30201 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HFEQ30201 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HFEQ30201 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HFEQ30201 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HFEQ30201 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HFEQ30201 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HFEQ30201 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HFEQ30201 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HFEQ30201 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HFEQ30201 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HFEQ30201 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HFEQ30201 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HFEQ30201 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HFEQ30201 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HFEQ30201 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HFEQ30201 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HFEQ30201 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HFEQ30201 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HFEQ30201 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HFEQ30201 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HFEQ30201 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HFEQ30201 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HFEQ30201 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HFEQ30201 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HFEQ30201 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HFEQ30201 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HFEQ30201 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HFEQ30201 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HFEQ30201 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HFEQ30201 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HFEQ30201 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HFEQ30201 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HFEQ30201 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HFEQ30201 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HFEQ30201 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HFEQ30201 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HFEQ30201 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HFEQ30201 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HFEQ30201 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HFEQ30201 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HFEQ30201 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HFEQ30201 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HFEQ30201 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HFEQ30201 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HFEQ30201 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HFEQ30201 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HFEQ30201 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HFEQ30201 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HFEQ30201 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HFEQ30201 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HFEQ30201 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HFEQ30201 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HFEQ30201 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HFEQ30201 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HFEQ30201 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HFEQ30201 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HFEQ30201 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HFEQ30201 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HFEQ30201 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HFEQ30201 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HFEQ30201 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HFEQ30201 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HFEQ30201 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HFEQ30201 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HFEQ30201 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HFEQ30201 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HFEQ30201 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HFEQ30201 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HFEQ30201 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HFEQ30201 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HFEQ30201 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HFEQ30201 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HFEQ30201 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HFEQ30201 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HFEQ30201 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HFEQ30201 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HFEQ30201 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HFEQ30201 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HFEQ30201 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HFEQ30201 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HFEQ30201 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HFEQ30201 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms