Protein–RNA interactions for Protein: Q16873

LTC4S, Leukotriene C4 synthase, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTC4SQ16873 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LTC4SQ16873 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LTC4SQ16873 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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