Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTN1Q16799 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
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