Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HMGN3Q15651 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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