Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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SIX1Q15475 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIX1Q15475 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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