Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEC23BQ15437 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEC23BQ15437 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEC23BQ15437 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms