Protein–RNA interactions for Protein: Q15049

MLC1, Membrane protein MLC1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLC1Q15049 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MLC1Q15049 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MLC1Q15049 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MLC1Q15049 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MLC1Q15049 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MLC1Q15049 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MLC1Q15049 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MLC1Q15049 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MLC1Q15049 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MLC1Q15049 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MLC1Q15049 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MLC1Q15049 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MLC1Q15049 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MLC1Q15049 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MLC1Q15049 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MLC1Q15049 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MLC1Q15049 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MLC1Q15049 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MLC1Q15049 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MLC1Q15049 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MLC1Q15049 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MLC1Q15049 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MLC1Q15049 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MLC1Q15049 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MLC1Q15049 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MLC1Q15049 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MLC1Q15049 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MLC1Q15049 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MLC1Q15049 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MLC1Q15049 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MLC1Q15049 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MLC1Q15049 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MLC1Q15049 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MLC1Q15049 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MLC1Q15049 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MLC1Q15049 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MLC1Q15049 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MLC1Q15049 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms