Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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ODF1Q14990 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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ODF1Q14990 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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