Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
KCNB1Q14721 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNB1Q14721 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNB1Q14721 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNB1Q14721 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms