Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1CQ13936 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
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