Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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GTF2H2Q13888 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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GTF2H2Q13888 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
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GTF2H2Q13888 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GTF2H2Q13888 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2H2Q13888 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2H2Q13888 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2H2Q13888 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2H2Q13888 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2H2Q13888 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2H2Q13888 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2H2Q13888 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2H2Q13888 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2H2Q13888 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2H2Q13888 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2H2Q13888 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2H2Q13888 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2H2Q13888 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
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GTF2H2Q13888 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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GTF2H2Q13888 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2H2Q13888 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2H2Q13888 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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GTF2H2Q13888 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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GTF2H2Q13888 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2H2Q13888 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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GTF2H2Q13888 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2H2Q13888 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2H2Q13888 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2H2Q13888 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2H2Q13888 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2H2Q13888 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2H2Q13888 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2H2Q13888 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2H2Q13888 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2H2Q13888 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2H2Q13888 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2H2Q13888 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2H2Q13888 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2H2Q13888 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GTF2H2Q13888 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2H2Q13888 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GTF2H2Q13888 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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