Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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ITGA9Q13797 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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ITGA9Q13797 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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ITGA9Q13797 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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ITGA9Q13797 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
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ITGA9Q13797 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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ITGA9Q13797 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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