Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAPSNQ13702 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms