Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXE3Q13461 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXE3Q13461 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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