Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RESTQ13127 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RESTQ13127 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RESTQ13127 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RESTQ13127 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RESTQ13127 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RESTQ13127 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RESTQ13127 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RESTQ13127 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RESTQ13127 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RESTQ13127 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RESTQ13127 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RESTQ13127 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RESTQ13127 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RESTQ13127 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RESTQ13127 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RESTQ13127 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RESTQ13127 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RESTQ13127 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RESTQ13127 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RESTQ13127 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RESTQ13127 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RESTQ13127 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RESTQ13127 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RESTQ13127 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RESTQ13127 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RESTQ13127 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RESTQ13127 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RESTQ13127 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RESTQ13127 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RESTQ13127 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RESTQ13127 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RESTQ13127 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RESTQ13127 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RESTQ13127 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RESTQ13127 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RESTQ13127 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RESTQ13127 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RESTQ13127 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RESTQ13127 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RESTQ13127 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RESTQ13127 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RESTQ13127 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RESTQ13127 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RESTQ13127 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RESTQ13127 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RESTQ13127 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RESTQ13127 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RESTQ13127 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RESTQ13127 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RESTQ13127 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RESTQ13127 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RESTQ13127 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RESTQ13127 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RESTQ13127 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RESTQ13127 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RESTQ13127 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RESTQ13127 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RESTQ13127 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RESTQ13127 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RESTQ13127 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RESTQ13127 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RESTQ13127 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RESTQ13127 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RESTQ13127 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RESTQ13127 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RESTQ13127 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RESTQ13127 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RESTQ13127 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RESTQ13127 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RESTQ13127 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RESTQ13127 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RESTQ13127 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RESTQ13127 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RESTQ13127 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RESTQ13127 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RESTQ13127 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RESTQ13127 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RESTQ13127 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RESTQ13127 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RESTQ13127 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RESTQ13127 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RESTQ13127 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RESTQ13127 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RESTQ13127 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RESTQ13127 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RESTQ13127 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RESTQ13127 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RESTQ13127 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RESTQ13127 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RESTQ13127 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RESTQ13127 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RESTQ13127 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RESTQ13127 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RESTQ13127 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RESTQ13127 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RESTQ13127 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RESTQ13127 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RESTQ13127 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RESTQ13127 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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