Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NFX1Q12986 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NFX1Q12986 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NFX1Q12986 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFX1Q12986 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFX1Q12986 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFX1Q12986 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFX1Q12986 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NFX1Q12986 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFX1Q12986 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFX1Q12986 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NFX1Q12986 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NFX1Q12986 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NFX1Q12986 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NFX1Q12986 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NFX1Q12986 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFX1Q12986 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NFX1Q12986 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFX1Q12986 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFX1Q12986 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NFX1Q12986 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFX1Q12986 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFX1Q12986 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFX1Q12986 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NFX1Q12986 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFX1Q12986 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NFX1Q12986 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFX1Q12986 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFX1Q12986 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFX1Q12986 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFX1Q12986 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NFX1Q12986 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NFX1Q12986 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NFX1Q12986 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NFX1Q12986 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFX1Q12986 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NFX1Q12986 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NFX1Q12986 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFX1Q12986 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFX1Q12986 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NFX1Q12986 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFX1Q12986 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NFX1Q12986 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFX1Q12986 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
NFX1Q12986 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFX1Q12986 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NFX1Q12986 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NFX1Q12986 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFX1Q12986 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFX1Q12986 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFX1Q12986 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFX1Q12986 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFX1Q12986 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFX1Q12986 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFX1Q12986 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFX1Q12986 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NFX1Q12986 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NFX1Q12986 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NFX1Q12986 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NFX1Q12986 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NFX1Q12986 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NFX1Q12986 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFX1Q12986 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NFX1Q12986 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NFX1Q12986 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NFX1Q12986 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFX1Q12986 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NFX1Q12986 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NFX1Q12986 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFX1Q12986 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFX1Q12986 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFX1Q12986 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NFX1Q12986 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NFX1Q12986 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFX1Q12986 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFX1Q12986 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFX1Q12986 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NFX1Q12986 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NFX1Q12986 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFX1Q12986 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFX1Q12986 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NFX1Q12986 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFX1Q12986 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NFX1Q12986 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFX1Q12986 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NFX1Q12986 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
NFX1Q12986 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFX1Q12986 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
NFX1Q12986 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NFX1Q12986 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NFX1Q12986 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NFX1Q12986 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFX1Q12986 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFX1Q12986 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFX1Q12986 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NFX1Q12986 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFX1Q12986 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NFX1Q12986 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFX1Q12986 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NFX1Q12986 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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