Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TRAF2Q12933 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF2Q12933 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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