Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRJQ12913 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRJQ12913 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms