Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX10Q12887 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX10Q12887 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX10Q12887 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX10Q12887 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX10Q12887 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
COX10Q12887 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX10Q12887 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
COX10Q12887 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
COX10Q12887 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
COX10Q12887 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX10Q12887 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX10Q12887 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX10Q12887 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX10Q12887 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX10Q12887 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX10Q12887 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX10Q12887 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX10Q12887 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX10Q12887 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX10Q12887 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX10Q12887 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX10Q12887 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COX10Q12887 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX10Q12887 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX10Q12887 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX10Q12887 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX10Q12887 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX10Q12887 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX10Q12887 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX10Q12887 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX10Q12887 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX10Q12887 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX10Q12887 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX10Q12887 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX10Q12887 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX10Q12887 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX10Q12887 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX10Q12887 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX10Q12887 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX10Q12887 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX10Q12887 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX10Q12887 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX10Q12887 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX10Q12887 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX10Q12887 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX10Q12887 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX10Q12887 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX10Q12887 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX10Q12887 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX10Q12887 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX10Q12887 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX10Q12887 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX10Q12887 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX10Q12887 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX10Q12887 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX10Q12887 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX10Q12887 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COX10Q12887 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COX10Q12887 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COX10Q12887 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COX10Q12887 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COX10Q12887 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COX10Q12887 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COX10Q12887 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COX10Q12887 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COX10Q12887 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COX10Q12887 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COX10Q12887 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COX10Q12887 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COX10Q12887 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COX10Q12887 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COX10Q12887 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COX10Q12887 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COX10Q12887 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COX10Q12887 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COX10Q12887 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COX10Q12887 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COX10Q12887 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
COX10Q12887 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COX10Q12887 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COX10Q12887 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COX10Q12887 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COX10Q12887 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COX10Q12887 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COX10Q12887 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COX10Q12887 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
COX10Q12887 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COX10Q12887 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COX10Q12887 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COX10Q12887 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COX10Q12887 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX10Q12887 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX10Q12887 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX10Q12887 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX10Q12887 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX10Q12887 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX10Q12887 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX10Q12887 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX10Q12887 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms