Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DEUP1Q05D60 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DEUP1Q05D60 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms