Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBE3AQ05086 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
UBE3AQ05086 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms