Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
GCNT1Q02742 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GCNT1Q02742 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GCNT1Q02742 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GCNT1Q02742 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GCNT1Q02742 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GCNT1Q02742 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GCNT1Q02742 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GCNT1Q02742 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GCNT1Q02742 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GCNT1Q02742 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GCNT1Q02742 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GCNT1Q02742 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GCNT1Q02742 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GCNT1Q02742 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GCNT1Q02742 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GCNT1Q02742 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GCNT1Q02742 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GCNT1Q02742 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GCNT1Q02742 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GCNT1Q02742 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GCNT1Q02742 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GCNT1Q02742 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GCNT1Q02742 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GCNT1Q02742 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GCNT1Q02742 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GCNT1Q02742 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GCNT1Q02742 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
GCNT1Q02742 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GCNT1Q02742 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GCNT1Q02742 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
GCNT1Q02742 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GCNT1Q02742 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
GCNT1Q02742 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GCNT1Q02742 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GCNT1Q02742 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
GCNT1Q02742 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GCNT1Q02742 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GCNT1Q02742 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GCNT1Q02742 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
GCNT1Q02742 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GCNT1Q02742 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GCNT1Q02742 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GCNT1Q02742 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms