Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NHLH2Q02577 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms