Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OC90Q02509 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OC90Q02509 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OC90Q02509 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OC90Q02509 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OC90Q02509 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OC90Q02509 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OC90Q02509 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OC90Q02509 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OC90Q02509 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OC90Q02509 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OC90Q02509 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OC90Q02509 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OC90Q02509 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OC90Q02509 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OC90Q02509 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OC90Q02509 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OC90Q02509 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OC90Q02509 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OC90Q02509 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OC90Q02509 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OC90Q02509 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OC90Q02509 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OC90Q02509 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OC90Q02509 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OC90Q02509 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OC90Q02509 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OC90Q02509 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OC90Q02509 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OC90Q02509 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OC90Q02509 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OC90Q02509 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OC90Q02509 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OC90Q02509 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
OC90Q02509 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OC90Q02509 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OC90Q02509 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OC90Q02509 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OC90Q02509 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OC90Q02509 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OC90Q02509 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OC90Q02509 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OC90Q02509 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OC90Q02509 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OC90Q02509 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
OC90Q02509 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OC90Q02509 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
OC90Q02509 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
OC90Q02509 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
OC90Q02509 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OC90Q02509 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OC90Q02509 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
OC90Q02509 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OC90Q02509 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OC90Q02509 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OC90Q02509 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OC90Q02509 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OC90Q02509 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OC90Q02509 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OC90Q02509 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
OC90Q02509 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
OC90Q02509 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OC90Q02509 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
OC90Q02509 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OC90Q02509 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
OC90Q02509 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OC90Q02509 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OC90Q02509 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OC90Q02509 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OC90Q02509 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OC90Q02509 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OC90Q02509 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
OC90Q02509 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
OC90Q02509 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OC90Q02509 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OC90Q02509 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OC90Q02509 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OC90Q02509 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OC90Q02509 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OC90Q02509 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OC90Q02509 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OC90Q02509 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OC90Q02509 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OC90Q02509 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OC90Q02509 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OC90Q02509 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OC90Q02509 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
OC90Q02509 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OC90Q02509 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OC90Q02509 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
OC90Q02509 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
OC90Q02509 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OC90Q02509 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OC90Q02509 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
OC90Q02509 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
OC90Q02509 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OC90Q02509 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OC90Q02509 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OC90Q02509 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OC90Q02509 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms