Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MS4A2Q01362 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms