Protein–RNA interactions for Protein: Q00604

NDP, Norrin, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDPQ00604 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDPQ00604 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NDPQ00604 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDPQ00604 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDPQ00604 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDPQ00604 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDPQ00604 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDPQ00604 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDPQ00604 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDPQ00604 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDPQ00604 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDPQ00604 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDPQ00604 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDPQ00604 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDPQ00604 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDPQ00604 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDPQ00604 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDPQ00604 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDPQ00604 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDPQ00604 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDPQ00604 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDPQ00604 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDPQ00604 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDPQ00604 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDPQ00604 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDPQ00604 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDPQ00604 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDPQ00604 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDPQ00604 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDPQ00604 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDPQ00604 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDPQ00604 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDPQ00604 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDPQ00604 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDPQ00604 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDPQ00604 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDPQ00604 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDPQ00604 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDPQ00604 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDPQ00604 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDPQ00604 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDPQ00604 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDPQ00604 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDPQ00604 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDPQ00604 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDPQ00604 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDPQ00604 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDPQ00604 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDPQ00604 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDPQ00604 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDPQ00604 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDPQ00604 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDPQ00604 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDPQ00604 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDPQ00604 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDPQ00604 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDPQ00604 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDPQ00604 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDPQ00604 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDPQ00604 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDPQ00604 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDPQ00604 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDPQ00604 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDPQ00604 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NDPQ00604 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDPQ00604 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NDPQ00604 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDPQ00604 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDPQ00604 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDPQ00604 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDPQ00604 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NDPQ00604 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDPQ00604 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDPQ00604 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDPQ00604 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDPQ00604 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDPQ00604 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDPQ00604 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDPQ00604 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDPQ00604 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDPQ00604 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDPQ00604 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDPQ00604 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDPQ00604 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDPQ00604 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDPQ00604 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDPQ00604 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDPQ00604 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDPQ00604 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDPQ00604 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDPQ00604 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDPQ00604 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDPQ00604 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDPQ00604 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDPQ00604 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDPQ00604 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDPQ00604 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDPQ00604 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDPQ00604 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDPQ00604 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms