Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP2P81877 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms