Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCNA1P78396 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCNA1P78396 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCNA1P78396 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNA1P78396 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNA1P78396 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNA1P78396 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNA1P78396 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNA1P78396 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNA1P78396 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNA1P78396 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNA1P78396 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNA1P78396 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNA1P78396 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNA1P78396 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNA1P78396 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNA1P78396 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNA1P78396 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNA1P78396 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNA1P78396 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNA1P78396 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNA1P78396 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNA1P78396 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNA1P78396 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNA1P78396 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNA1P78396 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNA1P78396 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNA1P78396 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNA1P78396 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNA1P78396 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNA1P78396 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNA1P78396 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNA1P78396 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNA1P78396 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNA1P78396 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNA1P78396 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNA1P78396 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNA1P78396 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNA1P78396 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNA1P78396 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNA1P78396 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNA1P78396 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNA1P78396 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNA1P78396 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNA1P78396 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNA1P78396 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNA1P78396 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNA1P78396 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNA1P78396 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNA1P78396 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNA1P78396 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNA1P78396 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNA1P78396 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNA1P78396 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNA1P78396 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNA1P78396 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNA1P78396 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms