Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS29P62273 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS29P62273 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS29P62273 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS29P62273 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS29P62273 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS29P62273 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS29P62273 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS29P62273 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS29P62273 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS29P62273 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS29P62273 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS29P62273 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS29P62273 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS29P62273 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS29P62273 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS29P62273 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS29P62273 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS29P62273 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS29P62273 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS29P62273 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS29P62273 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS29P62273 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS29P62273 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS29P62273 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RPS29P62273 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS29P62273 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS29P62273 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS29P62273 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS29P62273 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS29P62273 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS29P62273 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS29P62273 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS29P62273 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS29P62273 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS29P62273 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS29P62273 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS29P62273 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS29P62273 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS29P62273 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS29P62273 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS29P62273 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS29P62273 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS29P62273 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS29P62273 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS29P62273 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS29P62273 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS29P62273 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS29P62273 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS29P62273 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS29P62273 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS29P62273 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS29P62273 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS29P62273 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS29P62273 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS29P62273 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS29P62273 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS29P62273 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS29P62273 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS29P62273 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS29P62273 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS29P62273 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS29P62273 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS29P62273 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS29P62273 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS29P62273 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RPS29P62273 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
RPS29P62273 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
RPS29P62273 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
RPS29P62273 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
RPS29P62273 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
RPS29P62273 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
RPS29P62273 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
RPS29P62273 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
RPS29P62273 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
RPS29P62273 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
RPS29P62273 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
RPS29P62273 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS29P62273 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS29P62273 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS29P62273 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS29P62273 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS29P62273 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS29P62273 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS29P62273 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS29P62273 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS29P62273 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS29P62273 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS29P62273 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS29P62273 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS29P62273 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS29P62273 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS29P62273 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS29P62273 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS29P62273 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS29P62273 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS29P62273 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS29P62273 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS29P62273 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RPS29P62273 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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