Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FBXW4P57775 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FBXW4P57775 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FBXW4P57775 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FBXW4P57775 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FBXW4P57775 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FBXW4P57775 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FBXW4P57775 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FBXW4P57775 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FBXW4P57775 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FBXW4P57775 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FBXW4P57775 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FBXW4P57775 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FBXW4P57775 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FBXW4P57775 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FBXW4P57775 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FBXW4P57775 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FBXW4P57775 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FBXW4P57775 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FBXW4P57775 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FBXW4P57775 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FBXW4P57775 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FBXW4P57775 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FBXW4P57775 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FBXW4P57775 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FBXW4P57775 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FBXW4P57775 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FBXW4P57775 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FBXW4P57775 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FBXW4P57775 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FBXW4P57775 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FBXW4P57775 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FBXW4P57775 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FBXW4P57775 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FBXW4P57775 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FBXW4P57775 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FBXW4P57775 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms