Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EEFSECP57772 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms