Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

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Length 987 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EPHB4P54760 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EPHB4P54760 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EPHB4P54760 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EPHB4P54760 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EPHB4P54760 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EPHB4P54760 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EPHB4P54760 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EPHB4P54760 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EPHB4P54760 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EPHB4P54760 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
EPHB4P54760 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EPHB4P54760 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EPHB4P54760 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EPHB4P54760 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EPHB4P54760 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EPHB4P54760 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EPHB4P54760 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EPHB4P54760 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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