Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ETV1P50549 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ETV1P50549 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ETV1P50549 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ETV1P50549 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ETV1P50549 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ETV1P50549 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ETV1P50549 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ETV1P50549 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ETV1P50549 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ETV1P50549 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ETV1P50549 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ETV1P50549 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ETV1P50549 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ETV1P50549 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ETV1P50549 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ETV1P50549 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ETV1P50549 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ETV1P50549 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ETV1P50549 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ETV1P50549 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ETV1P50549 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ETV1P50549 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ETV1P50549 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ETV1P50549 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ETV1P50549 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ETV1P50549 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ETV1P50549 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ETV1P50549 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ETV1P50549 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ETV1P50549 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ETV1P50549 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ETV1P50549 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ETV1P50549 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ETV1P50549 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ETV1P50549 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ETV1P50549 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ETV1P50549 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ETV1P50549 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ETV1P50549 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ETV1P50549 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ETV1P50549 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ETV1P50549 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ETV1P50549 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ETV1P50549 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ETV1P50549 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ETV1P50549 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ETV1P50549 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ETV1P50549 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ETV1P50549 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ETV1P50549 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ETV1P50549 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ETV1P50549 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ETV1P50549 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ETV1P50549 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ETV1P50549 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ETV1P50549 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ETV1P50549 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ETV1P50549 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ETV1P50549 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ETV1P50549 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ETV1P50549 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ETV1P50549 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ETV1P50549 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ETV1P50549 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ETV1P50549 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ETV1P50549 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ETV1P50549 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ETV1P50549 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ETV1P50549 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ETV1P50549 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ETV1P50549 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ETV1P50549 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ETV1P50549 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ETV1P50549 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ETV1P50549 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ETV1P50549 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ETV1P50549 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ETV1P50549 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ETV1P50549 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ETV1P50549 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ETV1P50549 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ETV1P50549 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ETV1P50549 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ETV1P50549 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ETV1P50549 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ETV1P50549 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ETV1P50549 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ETV1P50549 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ETV1P50549 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ETV1P50549 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ETV1P50549 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ETV1P50549 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ETV1P50549 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ETV1P50549 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ETV1P50549 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ETV1P50549 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ETV1P50549 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ETV1P50549 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ETV1P50549 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms